Comme toute fédération, la mission de la FDEI est de représenter ses entreprises adhérentes auprès des pouvoirs publics et des partenaires sociaux et de participer aux débats professionnels sur les aspects législatifs et métier (loi sur l’eau, taxe professionnelle, écologie, cahiers des charges etc.). Au-delà, son objectif est de sensibiliser décideurs et usagers à l’importance de l’accroissement de la part des PME sur ce marché et de démontrer que les PME de l'eau constituent pour les collectivités locales une alternative fiable et engagée en matière de gestion et de distribution d’eau.